Dalam dunia biologi, terutama pada cabang taksonomi dan sistematika, kebutuhan akan stabilitas dan kejelasan adalah fundamental. Ketika seorang ilmuwan mendeskripsikan spesies baru, nama yang diberikan harus memiliki jangkar fisik yang tak terbantahkan. Jangkar inilah yang kita kenal sebagai holotipe. Holotipe bukan sekadar sampel atau spesimen acak; ia adalah entitas fisik tunggal yang secara permanen dan formal dikaitkan dengan deskripsi ilmiah nama takson. Tanpa keberadaan holotipe yang jelas, sistem penamaan ilmiah yang telah diwarisi selama berabad-abad akan runtuh dalam kekacauan penafsiran. Holotipe menjamin bahwa ketika kita menyebut Homo sapiens atau Rafflesia arnoldii, kita semua merujuk pada konsep biologis yang sama, terlepas dari batas geografis atau waktu.
Peran holotipe jauh melampaui sekadar identifikasi awal. Ia berfungsi sebagai titik referensi abadi—sebuah 'kamus fisik' yang dapat dikunjungi kembali oleh para peneliti di masa depan. Jika teknologi baru (misalnya, analisis DNA kuno atau mikroskopi resolusi tinggi) muncul, holotipe adalah objek yang akan diuji untuk memvalidasi atau merevisi pemahaman kita tentang batas-batas spesies. Oleh karena itu, konservasi holotipe, yang sering disimpan di museum dan herbarium utama dunia, adalah upaya kolektif global yang menopang seluruh arsitektur ilmu pengetahuan hayat.
Gambar: Representasi skematis dari pemeriksaan teliti sebuah holotipe.
Konsep penamaan ilmiah modern, yang dikodifikasi oleh Carl Linnaeus pada abad ke-18, awalnya tidak secara eksplisit memerlukan penetapan tipe spesimen dalam bentuk yang sangat ketat seperti yang kita kenal sekarang. Linnaeus mendeskripsikan spesies berdasarkan koleksi di berbagai museum dan kebun botani, namun seringkali deskripsinya didasarkan pada kumpulan material yang longgar atau bahkan ilustrasi. Namun, seiring dengan peningkatan jumlah spesies yang dideskripsikan dan tumbuhnya kompleksitas hubungan filogenetik, para taksonom menyadari perlunya presisi yang lebih tinggi.
Pada abad ke-19, ketika taksonomi berevolusi menjadi disiplin ilmu yang lebih formal dan terstruktur, para peneliti mulai menyadari bahwa konflik dan kebingungan seringkali muncul karena deskripsi yang ambigu. Jika dua taksonom memiliki pandangan berbeda mengenai batas-batas suatu spesies, harus ada satu objek fisik yang berfungsi sebagai wasit. Kebutuhan inilah yang memunculkan ide tentang 'spesimen tipe' (type specimen), dan holotipe adalah manifestasi paling penting dari konsep tersebut.
Penyusunan kode nomenklatur—seperti International Code of Zoological Nomenclature (ICZN) dan International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (ICN)—mengokohkan peran holotipe. Holotipe didefinisikan sebagai spesimen tunggal yang digunakan oleh penulis asli (otor) untuk mendeskripsikan dan menamai spesies, menjadikannya 'nama-bearing type'. Kode-kode ini memastikan bahwa penamaan ilmiah tidak didasarkan pada deskripsi subjektif semata, melainkan selalu terikat pada bukti material yang nyata.
Dalam konteks formal, holotipe adalah satu-satunya spesimen fisik yang, pada saat publikasi deskripsi takson, secara eksplisit ditunjuk oleh penulis sebagai spesimen yang menjadi dasar nama ilmiah. Ketegasan dalam penunjukan ini sangat krusial. Dalam ICZN, misalnya, aturan mengenai penunjukan holotipe sangat rinci, memastikan bahwa tidak ada ambiguitas mengenai identitas spesimen tersebut. Spesimen ini harus disimpan di koleksi institusional yang diakui secara permanen, seperti museum sejarah alam atau herbarium universitas, untuk memastikan aksesibilitas dan konservasi jangka panjang. Lokasi penyimpanan ini, yang dikenal sebagai repositori, harus dicatat dalam publikasi asli.
Keputusan taksonom untuk menunjuk holotipe membawa tanggung jawab besar, karena semua penelitian, identifikasi, dan perbandingan taksonomi di masa depan untuk spesies tersebut akan kembali merujuk pada spesimen ini. Sebuah holotipe mungkin berupa seluruh organisme, bagian dari organisme (seperti fosil gigi atau daun), atau bahkan, dalam kasus tertentu seperti mikroorganisme, kultur murni yang diawetkan dalam kondisi khusus (misalnya, di cryobank).
Tujuan utama dari sistem nomenklatur biologis adalah stabilitas. Nama ilmiah harus tetap konstan meskipun pemahaman kita tentang hubungan evolusioner spesies tersebut berubah. Holotipe adalah mekanisme utama yang mencapai stabilitas ini.
Dua prinsip utama mengatur nomenklatur. Pertama, Prinsip Prioritas (Principle of Priority), yang menyatakan bahwa nama ilmiah yang sah adalah nama tertua yang dipublikasikan secara valid. Kedua, Prinsip Tipifikasi (Principle of Typification), yang mengharuskan setiap nama ilmiah takson pada tingkat spesies dan di bawahnya harus secara permanen dikaitkan dengan spesimen tipe, yaitu holotipe.
Apabila terdapat kebingungan atau sinonim, holotipe berfungsi sebagai pembeda akhir. Jika dua nama ilmiah (A dan B) merujuk pada spesies yang sama, dan nama A diterbitkan lebih dahulu, maka A memiliki prioritas. Namun, untuk memastikan bahwa A memang merujuk pada konsep biologis yang sama dengan B, para taksonom harus memeriksa holotipe dari A dan B. Jika kedua holotipe ini secara morfologis, genetik, atau filogenetik dianggap mewakili spesies yang sama, maka nama yang lebih muda (B) menjadi sinonim junior, dan nama A dipertahankan. Stabilitas nomenklatur bergantung pada kemampuan kita untuk selalu kembali ke bukti fisik ini.
Holotipe memiliki kekuatan yang unik: ia tidak dapat digantikan. Kecuali dalam keadaan yang sangat jarang dan prosedural yang melibatkan penunjukan Neotype (akan dibahas lebih lanjut), holotipe asli selalu mempertahankan statusnya sebagai penjangkar nama tersebut, bahkan jika spesimen itu rusak, hancur, atau bahkan jika kemudian diketahui bahwa spesimen tersebut sebenarnya bukan representasi yang 'paling khas' dari populasi spesies tersebut.
Ini adalah poin penting yang sering disalahpahami. Holotipe tidak harus menjadi 'spesimen terbaik' atau 'rata-rata' dari spesies. Ia hanyalah spesimen yang secara harfiah membawa nama tersebut. Keputusan untuk mengganti holotipe hanya akan membawa ketidakstabilan masif ke dalam sistem. Oleh karena itu, jika holotipe tidak sempurna, para taksonom akan merujuk pada spesimen tambahan (paratipe atau isotipe) untuk memahami variasi spesies, tetapi holotipe tetap menjadi patokan nomenklatural.
Gambar: Wadah museum yang mengawetkan holotipe.
Meskipun holotipe adalah yang paling penting, nomenklatur mengenal beberapa jenis spesimen tipe lain yang memiliki fungsi pendukung atau pengganti, tergantung pada situasi deskripsi awal atau nasib holotipe itu sendiri.
Paratipe adalah spesimen tambahan yang digunakan oleh otor dalam deskripsi asli, selain holotipe. Paratipe membantu menggambarkan variasi alami dalam spesies, khususnya dimorfisme seksual atau variasi geografis. Mereka tidak membawa nama secara formal, tetapi memberikan konteks penting untuk interpretasi holotipe. Jika holotipe hilang, paratipe tidak secara otomatis mengambil alih peran holotipe; mereka tetap paratipe.
Isotipe adalah istilah yang terutama digunakan dalam botani (ICN). Isotipe adalah duplikat dari holotipe yang dikumpulkan pada waktu dan lokasi yang sama, dan merupakan bagian dari individu tumbuhan yang sama. Ini sangat penting karena seringkali kolektor membuat beberapa herbaria dari satu tanaman untuk didistribusikan ke berbagai institusi. Meskipun holotipe memiliki prioritas, isotipe berfungsi sebagai cadangan yang sangat berharga.
Sintipe muncul ketika seorang otor mendeskripsikan spesies berdasarkan serangkaian spesimen tanpa menunjuk secara eksplisit satu pun sebagai holotipe. Dalam kasus ini, semua spesimen yang dikutip dalam deskripsi asli adalah Sintipe. Sintipe menciptakan ketidakstabilan, karena taksonom di masa depan harus memilih salah satu dari Sintipe tersebut untuk ditetapkan sebagai Lektipe (Lectotype). Praktik penunjukan Sintipe kini sangat dilarang oleh kode nomenklatur modern.
Tipe pengganti diperlukan hanya ketika holotipe asli hilang atau hancur. Proses penetapan spesimen tipe pengganti adalah proses formal yang ketat dan membutuhkan justifikasi ilmiah yang kuat.
Lektipe adalah spesimen yang dipilih dari serangkaian Sintipe untuk berfungsi sebagai penjangkar nama ilmiah. Penunjukan Lektipe harus dilakukan oleh peneliti yang memublikasikan studi revisi, dan setelah ditetapkan, Lektipe memiliki status yang setara dengan holotipe untuk tujuan nomenklatur. Lektipe sangat umum ditemukan dalam spesies-spesies yang dideskripsikan pada era pra-1900, ketika praktik penunjukan holotipe belum terstandarisasi.
Neotipe adalah spesimen baru yang ditunjuk sebagai tipe nama ketika holotipe (dan semua paratipe, isotipe, atau sintipe jika ada) diyakini telah hilang atau hancur. Penetapan Neotipe adalah langkah drastis. ICZN dan ICN hanya mengizinkan penunjukan Neotipe jika hal itu mutlak diperlukan untuk menjamin stabilitas nama taksonomi—misalnya, jika ketidakpastian mengenai identitas takson tersebut menghambat penelitian lebih lanjut secara serius. Penetapan ini harus disertai bukti bahwa Neotipe tersebut paling mendekati deskripsi asli dan harus dipublikasikan secara eksplisit.
Epitipe adalah istilah yang lebih baru, terutama digunakan dalam ICN, merujuk pada spesimen tambahan yang ditunjuk untuk membantu interpretasi holotipe atau lektipe ketika spesimen tipe asli terbukti ambigu, terutama karena kerusakan atau kurangnya fitur diagnostik yang dapat dianalisis dengan teknologi modern (misalnya, urutan DNA). Epitipe tidak menggantikan holotipe, tetapi bertindak sebagai alat klarifikasi, seringkali mencakup data molekuler yang tidak tersedia saat deskripsi awal.
Peran holotipe sebagai repositori informasi taksonomi menjadikannya aset paling berharga di museum sejarah alam. Namun, konservasi spesimen ini dihadapkan pada tantangan lingkungan, konflik kelembagaan, dan tuntutan ilmu pengetahuan modern yang terus berubah.
Sebuah holotipe harus disimpan dalam institusi permanen yang memiliki sumber daya untuk konservasi jangka panjang. Institusi-institusi ini (seperti Museum Sejarah Alam London, Muséum national d'Histoire naturelle di Paris, atau Smithsonian) memastikan bahwa spesimen terlindungi dari kerusakan fisik, hama, dan kondisi lingkungan yang merusak.
Namun, dengan meningkatnya laju deskripsi spesies baru, muncul tantangan logistik mengenai di mana spesimen ini harus disimpan. Banyak negara berkembang yang kaya keanekaragaman hayati kini bersikeras bahwa holotipe yang dikumpulkan di wilayah mereka harus disimpan di institusi nasional (sesuai dengan semangat Konvensi Keanekaragaman Hayati/CBD), alih-alih di museum di negara-negara maju yang memiliki sejarah koleksi kolonial. Hal ini memunculkan isu penting mengenai kapasitas penyimpanan, pelatihan kurator, dan keamanan di institusi baru.
Abad ke-21 telah membawa revolusi digitasi. Proyek-proyek besar kini berupaya untuk memindai setiap holotipe yang ada di dunia dengan resolusi tinggi (baik 2D maupun 3D), membuat citra-citra ini tersedia secara daring bagi setiap peneliti di mana pun. Digitasi mengurangi kebutuhan untuk meminjam spesimen fisik, yang merupakan sumber utama kerusakan, sekaligus meningkatkan akses global secara dramatis.
Selain citra visual, data molekuler kini menjadi komponen integral. Para taksonom seringkali berusaha mengekstrak DNA dari holotipe (meskipun ini berisiko merusak spesimen). Data urutan genetik dari holotipe, yang dikenal sebagai 'barcode tipe', adalah informasi diagnostik baru yang harus dilampirkan pada catatan spesimen. Integrasi data morfologi, geografi, dan genetik pada tingkat holotipe menjadi norma baru, memperkuat daya tahan taksonomi.
Penggunaan holotipe untuk analisis destruktif, seperti ekstraksi DNA, menimbulkan dilema etika. Haruskah spesimen unik yang merupakan jangkar permanen suatu nama dikorbankan demi informasi genetik yang mungkin hanya valid sebagian? Komunitas taksonomi biasanya mengikuti prinsip 'pemanfaatan minimal': hanya menggunakan sampel yang benar-benar diperlukan, dan jika mungkin, menggunakan paratipe terlebih dahulu.
Isu keberlanjutan juga mencakup perlindungan hukum. Spesies yang baru dideskripsikan, yang holotipenya terancam (misalnya, karena spesimen tersebut berasal dari wilayah yang rawan konflik atau bencana alam), memerlukan protokol konservasi yang lebih ketat, termasuk penyimpanan duplikat aman (isotipe) di berbagai lokasi geografis. Regulasi internasional seperti CITES (Convention on International Trade in Endangered Species) juga dapat memengaruhi pergerakan holotipe di seluruh dunia, membutuhkan izin formal untuk peminjaman spesimen yang terancam.
Konsep holotipe tidak terbatas pada zoologi atau botani makroskopis. Aturan dan prinsip yang sama, meskipun dengan modifikasi teknis, berlaku di seluruh domain kehidupan.
Dalam botani dan mikologi (diatur oleh ICN), holotipe biasanya adalah spesimen kering dan pipih yang dipasang pada lembaran kertas herbarium. Tantangannya adalah satu spesimen mungkin hanya mewakili sebagian kecil dari siklus hidup atau variasi morfologi tanaman. Ini adalah alasan mengapa spesimen tambahan seperti Isotipe (duplikat), Sintipe, atau bahkan Topotipe (spesimen yang dikumpulkan di lokasi tipe) sangat penting dalam botani. Jika holotipe adalah alga atau jamur mikroskopis, ia mungkin disiapkan sebagai preparat mikroskopis permanen, dan preparat tunggal itulah yang menjadi holotipe.
Jika nama botani didasarkan pada ilustrasi sebelum tahun 1958 (di mana spesimen herbarium tidak tersedia), maka ilustrasi tersebut secara efektif dapat berfungsi sebagai tipe, dan ini seringkali menjadi sumber kebingungan taksonomi hingga Lektipe yang sesuai ditetapkan.
Dalam paleontologi, holotipe adalah spesimen fosil—bisa berupa kerangka lengkap, cetakan jejak kaki, atau bahkan mikroorganisme yang terawetkan di batuan. Fosil seringkali tidak lengkap atau terdistorsi, membuat penafsiran holotipe menjadi sangat sulit.
Contoh paling terkenal adalah holotipe Tyrannosaurus rex. Fosil pertama yang diidentifikasi sebagai T. rex oleh Henry Fairfield Osborn pada tahun 1905, meskipun tidak lengkap, berfungsi sebagai holotipe. Semua penemuan T. rex berikutnya harus dibandingkan dengan spesimen tipe ini. Karena spesimen fosil tidak dapat direplikasi, konservasi holotipe paleontologi sering melibatkan penanganan yang sangat hati-hati dan pemindaian 3D untuk menciptakan replika digital yang dapat diakses tanpa merusak materi asli.
Prokaryota (bakteri dan archaea) diatur oleh International Code of Nomenclature of Prokaryotes (ICNP). Karena organisme ini adalah entitas mikroskopis dan berubah-ubah, holotipe dalam bakteriologi bukanlah spesimen fisik tunggal, melainkan 'kultur tipe' (type strain). Kultur ini adalah kultur murni dari strain yang menjadi dasar deskripsi, dan harus disimpan secara metabolik tidak aktif (misalnya, dibekukan atau dikeringkan beku) di setidaknya dua koleksi kultur independen di negara yang berbeda.
Kultur tipe ini harus dapat diakses dan diaktifkan kembali. Jika kultur tipe hilang atau tidak dapat diaktifkan kembali, kultur lain yang sesuai akan diusulkan sebagai Neotype. Dalam bakteriologi modern, informasi genetik (urutan genom lengkap) dari kultur tipe menjadi kriteria diagnostik primer yang melengkapi deskripsi holotipe kultur tersebut.
Meskipun prinsipnya holotipe harus abadi, sejarah taksonomi penuh dengan kasus di mana holotipe hilang, hancur, atau rusak total, memaksa taksonom untuk melakukan intervensi melalui penetapan tipe pengganti. Intervensi ini, meskipun perlu, selalu membawa risiko ketidakpastian.
Banyak holotipe yang dikumpulkan pada masa awal eksplorasi (abad ke-17 hingga ke-19) telah hilang akibat perang, bencana alam (kebakaran museum), atau pengelolaan koleksi yang buruk. Ketika holotipe hilang, nama ilmiah yang melekat padanya menjadi tidak memiliki jangkar fisik. Jika nama tersebut tidak sering digunakan, nama tersebut mungkin ditinggalkan. Namun, jika nama tersebut merujuk pada takson yang penting atau luas (misalnya, hama pertanian atau spesies ikonik), ketidakstabilan ini harus diatasi.
Proses penetapan Neotype dalam kasus hilangnya holotipe harus melalui pemeriksaan yang sangat ketat. Taksonom harus membuktikan secara meyakinkan bahwa semua materi tipe asli (holotipe, paratipe, sintipe, dll.) memang tidak ada lagi dan upaya pencarian telah dilakukan secara menyeluruh. Selain itu, Neotype yang diusulkan harus dikumpulkan sedekat mungkin dengan lokasi tipe asli dan harus sesuai dengan deskripsi asli sejauh mungkin.
Dalam beberapa dekade terakhir, penggunaan Epitipe telah menjadi mekanisme penting untuk mengatasi ambiguitas holotipe yang ada tetapi rusak. Misalnya, sebuah spesimen holotipe botani mungkin sangat tua dan hanya menyisakan beberapa fragmen bunga tanpa informasi genetik. Jika taksonomi modern membagi spesies tersebut menjadi dua berdasarkan data DNA, holotipe asli tidak dapat memberikan jawaban yang jelas. Dalam skenario ini, Epitipe baru ditunjuk, seringkali berupa spesimen yang segar dan lengkap dari lokasi tipe, untuk melengkapi holotipe yang ambigu dengan data molekuler baru.
Namun, setiap penetapan tipe pengganti (Lektipe, Neotipe, Epitipe) harus dipublikasikan secara formal dan tunduk pada tinjauan komunitas ilmiah. Ada perdebatan yang intens mengenai apakah penunjukan Neotipe yang didasarkan pada kriteria molekuler, padahal holotipe asli hanya didasarkan pada morfologi, benar-benar menjamin konservasi arti nama yang dimaksud oleh otor awal. Keraguan ini menyoroti pentingnya holotipe asli sebagai titik awal yang ideal.
Masa depan holotipe terletak pada integrasi penuh data fisik dan digital, didukung oleh standar konservasi yang ditingkatkan dan kerja sama internasional.
Upaya global kini berfokus pada standarisasi protokol untuk konservasi holotipe. Ini mencakup tidak hanya kontrol iklim dan pencegahan hama, tetapi juga penggunaan metode pengawetan non-destruktif. Misalnya, penggunaan mikroskopi resolusi tinggi yang menghasilkan data 3D tanpa perlu menyentuh atau memindahkan spesimen. Standarisasi ini penting agar data yang dihasilkan dari holotipe di satu museum dapat dibandingkan langsung dengan data dari holotipe di museum lain.
Selain itu, pengamanan holotipe dari bencana alam atau konflik politik telah menjadi perhatian serius. Institusi-institusi besar mulai mempertimbangkan penyimpanan cadangan digital dan fisik yang didistribusikan secara geografis, menciptakan 'bank aman' global untuk data tipe.
Dengan kemajuan sekuensing genom, data DNA sekarang menjadi bagian tak terpisahkan dari deskripsi spesies. Holotipe masa depan diharapkan tidak hanya berupa spesimen fisik, tetapi juga 'data tipe' yang mencakup genom lengkap. Hal ini menimbulkan pertanyaan baru: manakah yang lebih permanen, spesimen fisik yang rentan rusak, atau urutan data digital yang rentan terhadap perubahan format teknologi?
Kecerdasan Buatan (AI) juga mulai berperan dalam taksonomi, membantu para peneliti membandingkan citra digital holotipe dengan spesimen lapangan baru secara otomatis, mempercepat proses identifikasi dan memvalidasi batas-batas spesies berdasarkan spesimen tipe. Namun, AI hanya dapat melayani—holotipe fisik tetap menjadi sumber daya primer yang memberi makan sistem AI tersebut.
Keberlangsungan sistem holotipe sangat bergantung pada generasi taksonom dan kurator berikutnya. Pelatihan dalam manajemen koleksi tipe, penggunaan teknologi digitasi, dan pemahaman mendalam tentang kode nomenklatur adalah vital. Di negara-negara yang baru membangun koleksi nasional, pelatihan ini memastikan bahwa spesimen holotipe, yang merupakan warisan ilmiah nasional, dikelola sesuai dengan standar internasional tertinggi.
Holotipe adalah investasi jangka panjang. Nilai spesimen ini meningkat seiring waktu karena teknologi yang lebih baik memungkinkan kita untuk mengekstrak lebih banyak informasi (misalnya, isotop, DNA lingkungan, biomolekul) tanpa merusaknya. Oleh karena itu, dukungan pendanaan untuk repositori tipe harus dianggap sebagai bagian tak terpisahkan dari infrastruktur ilmiah global.
Di masa lalu, holotipe ditempatkan dalam kerangka taksonomi yang statis, berfokus pada morfologi. Kini, dengan dominasi sistematika molekuler, holotipe harus diintegrasikan ke dalam kerangka filogenetik yang dinamis.
Sistem filogenetik modern sering mengungkapkan bahwa spesies yang secara tradisional dianggap tunggal (berdasarkan holotipe morfologis yang tunggal) sebenarnya adalah kompleks spesies (cryptic species) yang terdiri dari beberapa garis keturunan yang terpisah secara genetik. Ketika ini terjadi, holotipe memainkan peran penting dalam menentukan di mana nama ilmiah yang ada harus diaplikasikan. Nama tersebut harus tetap melekat pada garis keturunan yang diwakili oleh holotipe tersebut, dan garis keturunan lainnya harus diberikan nama baru.
Misalnya, jika holotipe A ternyata adalah bagian dari Garis Keturunan 1, maka nama A akan diterapkan hanya pada Garis Keturunan 1, dan spesies yang tersisa (Garis Keturunan 2 dan 3) harus dideskripsikan sebagai takson baru, masing-masing dengan holotipe baru. Proses ini, yang disebut sebagai "fiksasi nama," memastikan bahwa nama lama (A) tidak mengapung tanpa acuan yang jelas dalam kerangka evolusioner baru.
Tuntutan terhadap holotipe kini jauh lebih besar daripada pada abad ke-19. Dulu, diagnosis mungkin hanya memerlukan deskripsi bentuk tubuh. Hari ini, diagnosis yang lengkap seringkali memerlukan data habitat, ekologi, perilaku, dan yang terpenting, data molekuler. Holotipe, sebagai spesimen fisik, seringkali gagal memberikan semua informasi ini.
Namun, holotipe mempertahankan statusnya karena ia adalah satu-satunya bukti yang terikat pada publikasi awal. Meskipun holotipe tidak memberikan semua informasi yang diinginkan, ia secara formal mendefinisikan batas nama taksonomi. Informasi tambahan (dari paratipe, isotipe, atau bahkan spesimen non-tipe yang dipublikasikan) dapat digunakan untuk memperkaya pemahaman kita tentang spesies, tetapi tidak untuk mengubah arti nomenklatural yang terikat pada holotipe.
Tidak semua holotipe berupa serangga kering atau daun herbarium. Beberapa holotipe sangat unik, mencerminkan keragaman luar biasa kehidupan di Bumi dan tantangan konservasi yang menyertainya.
Spesies yang tidak memiliki struktur keras (misalnya cacing pipih, ubur-ubur) seringkali mengalami perubahan bentuk drastis saat diawetkan. Holotipe spesies ini mungkin terlihat sangat berbeda dari organisme hidup. Hal ini menyoroti perlunya deskripsi yang sangat rinci mengenai kondisi spesimen saat diawetkan, serta pentingnya gambar dan catatan lapangan. Dalam kasus ubur-ubur atau siput laut, holotipe mungkin berupa spesimen yang diawetkan dalam cairan (seperti etanol atau formalin), yang memerlukan prosedur konservasi dan penanganan yang sangat berbeda dari spesimen kering.
Meskipun kode nomenklatur saat ini sangat menuntut adanya spesimen fisik, ada perdebatan yang berkembang mengenai spesies yang sulit atau mustahil diawetkan secara fisik, atau yang keberadaannya hanya diketahui melalui DNA lingkungan (eDNA).
Meskipun saat ini eDNA saja tidak dapat menjadi holotipe formal di bawah kode yang berlaku, ada diskusi intensif mengenai adaptasi nomenklatur untuk masa depan, di mana holotipe dapat mencakup data molekuler yang sangat terstandarisasi. Proposal ini, yang dijuluki sebagai "Digital Holotypes" atau "Kodenominasi", bertujuan untuk menjamin stabilitas nama taksonomi bagi takson-takson yang tidak dapat direpresentasikan secara fisik, namun memerlukan kejelasan nomenklatur. Namun, transisi ke model ini membutuhkan perubahan mendasar dalam filosofi taksonomi, yang telah berakar pada bukti material fisik selama lebih dari dua abad.
Holotipe adalah jantung dari ilmu taksonomi. Ia adalah manifestasi fisik dari keputusan ilmiah yang secara permanen menautkan nama linguistik (nama ilmiah) dengan entitas biologis yang nyata. Perannya sebagai jangkar stabilitas nomenklatur adalah absolut dan tidak dapat digantikan oleh deskripsi, gambar, atau bahkan data genomik, kecuali dalam keadaan formal yang sangat ketat.
Setiap holotipe menceritakan kisah tentang spesies, kolektor, dan waktu spesimen itu dikumpulkan. Konservasi setiap spesimen tunggal ini di museum dan herbarium global bukan sekadar pekerjaan arsip; itu adalah pekerjaan ilmiah aktif yang menopang seluruh pemahaman kita tentang keanekaragaman hayati. Tanpa holotipe yang terawat dengan baik dan dapat diakses, setiap upaya deskripsi spesies, studi filogeni, dan perlindungan konservasi di seluruh dunia akan kehilangan fondasi yang kokoh. Oleh karena itu, kewajiban untuk melindungi, mendigitalkan, dan menganalisis holotipe secara non-destruktif adalah mandat abadi komunitas biologi. Holotipe, dalam kesederhanaan fisiknya, tetap menjadi pilar stabilitas abadi bagi ilmu hayat.